办理食品生产企业基本手续流程如下：1、学习《食品安全法》、《食品生产许可管理办法》。2、确定生产产品种类。3、确定对应种类产品执行标准。4、熟悉《食品生产许可审查通则》、对应产品审查细则。5、确定产品生产工艺流程图及操作规程。6、设计厂区平面图和设备布局图。7、施工与安装调试设备、化验室设备检定。8、试生产产品并进行检验。9、准备申请资料、各项制度和对应表格。10、根据《食品生产许可管理办法》第十条。申请食品生产许可，应当先行取得营业执照等合法主体资格。企业法人、合伙企业、个人独资企业、个体工商户等，以营业执照载明的主体作为申请人。第十一条；