被告公司一般不可以注销。由于被告公司在进行诉讼时，权利义务关系尚未明确，公司的清算组也不能准确的确定公司的资产和债权债务情况，所以要等诉讼结束后，公司经依法清算，才能申请办理注销登记。被告的公司注销了如何起诉，公司被告可以注销吗。公司注销后，该主体已经消失，向人民提起民事诉讼时，需要有明确的被告，已经注销的公司不符合条件，无法起诉该公司。若该公司股东存在出资不足或者注销后有公司财产剩余的，可以起诉该公司的股东。【法律依据】；《民事诉讼法》第一百一十九条，起诉必须符合下列条件。(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织。(二)有明确的被告。(三)有具体的诉讼请求和事实、理由。(四)属于人民受理民事诉讼的范围和受诉人民管辖。被告人的公司可以注销吗。