当事人因合同的履行过程之中发生合同纠纷，往往给一方当事人带来巨大的损失。所以，发生合同纠纷第一时间选择法律途径维护自己的合法权益，不是采用过激手段或默默承受损失。一、发生运输合同纠纷如何处理。一、协商：当事人自行协商解决合同纠纷，是指合同纠纷的当事人，在自愿互谅的基础上自行解决合同纠纷的一种方式。二、调解：合同纠纷的调解，是指双方当事人自愿在第三者（即调解的人）的主持下，在查明事实、分清是非的基础上，由第三者对纠纷双方当事人进行说明劝导，促使他们互谅互让，达成和解协议，从而解决纠纷的活动。