非淋病的最好治疗方法是使用抗生素进行治疗。非淋病一般由革兰阴性细菌引起，通常可选择使用单剂口服抗生素，如头孢哌酮/舒巴坦、阿奇霉素、环丙沙星等。在治疗期间，应避免性行为，同时治疗时需找寻全部的性伙伴与之同时治疗。由于非淋病容易与其他性传播疾病并存，如淋病、梅毒、艾滋病等，建议在确诊和治疗时进行性传播疾病全面筛查。此外，定期进行性传播疾病的筛查以及正确使用安全套也是预防非淋病的重要措施。