长江科学院总工程师级别是副局级。总工程师，又称首席工程师。在产品项目制运作的组织机构中是一种行政职务，在职能部门制运作的组织机构中是一种专业技术职务，但不是技术职称。在技术上，总工程师必须具备工程系列的专业技术职称，在行政上，他（她）是整个单位或项目的工程技术负责人。长江科学院始建于1951年，是国家社会公益类科研机构，隶属水利江水利委员会，主要为国家水利事业以及长江流域保护、治理、开发与管理提供科技支撑，同时面向国民经济建设相关行业提供科技服务。