军官代职跟借调的区别是性质不同。军官代职指军官暂时担任一定职务的代理，通常是在上级命令或安排下，根据需要、临时或特殊情况，军官被指派或委任担任特定职务，并暂时行使该职务的权责。借调指军官暂时从原或岗位调离，被派往其他或岗位工作一段时间。借调通常是基于战备需要、特定任务或专业技能需求等原因而进行的，军官在借调期间被指派到其他或单位任职。