合肥工业大学能签纸质三方。三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。签署三方协议时，建议遵循法律法规，并确保协议中的内容明确、合法，并得到各方的充分理解和同意。