个人所得税退款了，单位是查不到的，除非是个人由企业给汇算清缴。如果你申请没有通过公司，完全不会。多缴纳的部分，退回到你个人账户上面。法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》。第十四条扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴个人所得税申报表。纳税人办理汇算清缴退税或者扣缴义务人为纳税人办理汇算清缴退税的，税务机关审核后，按照国库管理的有关规定办理退税。