社保被重复扣了两次款，可前往当地社保经办机构办理社保费用退款手续。参保人应携带身份证原件及复印件、社保卡、重复缴纳社保费用的凭证、劳动合同、补缴冲销保险费申报表、单位书面申请书等。具体办理流程如下：1、携带相关资料，前往当地社保机构窗口提交材料，申请办理社保退费。或在社保官网上申请办理社保重复缴费处理，填写并打印申请表。2、由社保经办机构对资料进行审核。