夫妻财产协议公证的程序如下：一、当事人要带好所需的相关材料。二、双方共同亲自到公证处提出公证申请，填写公证的申请表格。三、公证申请被接待公证员受理后，公证员就财产协议的内容，审查财产的权利证明。查问当事人的订约是否受到欺骗或误导。四、双方当事人在公证员面前在财产协议书上签名。