仲裁可以确认合同无效。依据我国相关法律的规定，仲裁庭有权确认合同的效力，所以仲裁是可以确认合同无效的，并且仲裁协议是存在的，合同就更不影响仲裁协议的效力。法律依据；《仲裁法》第二条，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。