法律分析。仲裁机构可以确认合同无效。依据我国相关法律的规定，仲裁庭有权确认合同的效力，所以仲裁是可以确认合同无效的，并且仲裁协议是存在的，合同就更不影响仲裁协议的效力。法律依据；《仲裁法》 第十七条。有下列情形之一的，仲裁协议无效。（一）约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的。（二）无民事行为能力人或者民事行为能力人订立的仲裁协议。（三）一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。《仲裁法》 第十。仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确的，当事人可以补充协议。达不成补充协议的，仲裁协议无效。