夫妻在分居后两年不可以自动离婚。夫妻无论分居多久都是不会自动离婚的。我国法律并没有规定自动离婚的情形。离婚只能协议离婚或者是诉讼离婚。协议离婚的，双方协商好之后，签订书面离婚协议，去民政局办理离婚登记即可。诉讼离婚的，一方拟好起诉书，准备好夫妻感情破裂的证据，去当地的起诉离婚即可。一般情况，因感情不合分居满二年经调解无效的，会判决准予离婚。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第一千零七十九条 夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚。（一）重婚或者与他人同居。（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员。