运输合同纠纷的管辖原则如下：1、如果使用单一的运输工具，管辖将根据不同的运输工具确定。如果使用水运，由海事管辖，铁路运输由铁路运输管辖。2、联合运输的，根据具体情况，与海事有关的，由海事管辖，与铁路运输有关的，由铁路运输管辖。3、在联合运输中，如果同时有水运和铁路运输，法律没有具体规定如何确定管辖。在这种情况下，当事人可以选择管辖。根据《中华人民共和国民法典》的规定，依法成立的合同对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行义务，不得擅自变更或者解除合同。依法成立的合同受法律保护。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第四百六十五条 依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。