仅在以下情形中，公司据此扣除员工工资并不侵犯其权利。1.员工违反明确的合法规定。2.因其过失对公司带来经济损失。3.扣薪金额符合相关法规及公司规定。然而，公司无理由任意扣除工资，或超出员工当月工资一定比例（通常为20%），均属违法行为。建议您审查公司扣薪原因及依据，如发现公司违规操作，可先行与之沟通，若协商无效，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以保障自身权益。