依法规定，个人所得税应由纳税人自行负担，公司仅负代扣代缴之义务。因此，公司必须根据员工实收利益，精确核算纳税金额，自员工薪资中代为扣除，并准时将税款交至税务机关。如果公司未经合法程序，私自挪用员工工资进行纳税，将会侵犯员工对于自己工资的自主使用权。员工如遇此类情形，可首先尝试与公司进行有效协商，寻求纠正错误并返还多扣款项的解决方案。如协商不成，则可以选择向劳动监察部门投诉或者发起劳动仲裁，以保障自身合法权益不受损害。