另外，南京21路公交从南京西站到公交车辆厂的运营时间也有不同，首班车从南京西站出发的时间是5点30分，而末班车则在晚上23点00分离开。这条线路同样经过多个关键站点，如南京西站、双门楼宾馆、盐仓桥、大桥饭店、兴中门、静海寺纪念馆、虎踞北路草场门、虎踞路草场门、国防园、虎踞路清凉山、虎踞南路汉中门虎踞路汉中门、虎踞南路建邺路、虎踞南路水西门、凤台路水西门、银桥市场、赛虹桥以及凤台南路。