没有关系。在动漫《秦时明月》中，东皇太一的棋子是干将和莫邪，并没有仇人，所以不存在两人有什么关系。东皇太一是中国神话中的天神，处于众神之巅，为众神之皇，与西王母共同主宰和掌管天地人之事。