学籍这个东西自从被高中学校录取后，就已经从初中转到了高中，并会一直保存到高中毕业。只要不转学、退学等，就不会影响大学学籍。而且大学学籍是从大学开始，与高二期末考试无关，因此，高二期末缺考是不会影响到自己的大学学籍的。