两者都属于复合染料，是通过荧光共振能量转移原理，将小分子染料和荧光蛋白串联在一起组成的染料。这两者是可以一起使用的。在多数的流式仪器上，PECy7和APCCy7是可以同时使用的。该两种染料是被不同的激光激发的，发射光一样，在大多数的流式仪器上是可以同时使用的。