建筑工程停工两年后重新启动，前期需要进行一系列的准备和提交相关资料。首先，根据《建筑工程施工许可管理办法》第九条的规定，如果工程曾因故中止施工满一年，建设单位在恢复施工前必须向发证机关申请核验施工许可证。在提交申请时，建设单位需报告中止施工的详细情况，包括中止时间、原因、停工部位以及采取的维修和管理措施，并确保建筑工程在停工期间得到妥善维护。在报告中，建设单位还需提供中止施工以来的工程进展和管理情况，以证明他们已经具备继续施工的条件。同时，针对我国建设工程合同管理中存在的一些问题，如招标投标不规范和合同签订不平等，建设单位在重启项目时也需确保自身的合规性。例如，避免采用不正当手段参与招标，同时在合同谈判中争取更为平等和合理的原则，以保障自身权益和项目顺利进行。