该车型的亮点之一是其高效的发动机设计，该发动机采用四缸、四冲程、四个气门的设计，并且配备顶置双凸轮轴(DOHC)配气机构。实际排量为599cc，压缩比高达13.1：1，最大功率可达到91千瓦，最大扭矩为65.7牛·米，同时，它还配备了先进的水冷系统和电子燃油喷射系统（电喷）。在传动系统方面，雅马哈R6装备了六速国际齿轮变速箱，并通过链条传动确保动力传递的平顺性。在轮胎和制动系统方面，这款摩托车配备了轻质铝合金轮毂和真空轮胎，前轮规格为120/70ZR17，后轮规格为180/55ZR17。其制动系统由前双盘式刹车和四活塞卡钳，以及后单盘式刹车和单活塞卡钳组成，共同确保了行驶过程中的安全性能。