在南京，申请食品经营许可证通常需要5至7个工作日，或者在20个工作日内完成整个流程。提交必要的申请材料和填写申请表后，相关部门将对材料进行形式审查和现场核查。最终，市场监督管理局将决定是否发放经营许可证。为获取最准确的信息，建议直接咨询当地相关部门或访问官方网站，也可以通过南京市市场监督管理局的官方网站了解《食品经营许可证》的申请流程和预计时间。