执法机构有权依法追回这些不当收益，包括员工的工资。然而，员工是否知情其所在公司进行非法集资活动，对其责任判定至关重要。若员工对此毫不知情，责任判定及追回不当收益的方式可能会有所不同。总的来说，非法集资行为中的员工用工资购房，很有可能被视为违法处理不当收益。