一般情况下，公司无合法证明及恰当流程进行工资扣除便有可能涉及到违法行为。例如，在劳动合同或企业规定中注明了特定条件下可实施扣减，只要这些条例未违反法律，且扣除过程依照既定程序执行，这种情况就可以视为合法的。然而，如果企业的扣款随意性大，如无理牵强的原因、超越合理范围的扣除，或是未经法定程序，那么这无疑是违法的。员工有权要求企业全额支付被非法扣除的工资。若企业拒绝，员工有权利向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以保护自己的合法权益。