工程履约保函的有效期限一般不超过工程竣工验收后的三个月。具体的有效期根据工程合同中的约定来确定，建议在合同中明确双方协商后的具体期限。工程履约保函是为了确保工程合同的履行而设立的一种担保方式。其有效期限的设置是为了保障工程项目在实施过程中，承包商按照合同约定履行其义务，直至工程竣工验收并完成相关后续工作。因此，履约保函的有效期限通常与工程进度、验收及后续工作的时间节点紧密相关。