1、科属不同：发菜是蓝藻门念珠藻目的一种藻类；海发菜是蓝菌门念珠藻目的一种藻类。2、颜色不同：发菜外表呈黑色；海发菜外表呈绿色。3、吃法不同：发菜大多用来煮烫、凉拌吃；海发菜大多以凉拌为主。