违法。根据查询我国《劳动合同法》规定，个人与公司用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立并给予盖章证明，如双方并没有订立劳动合同的，单位不能给予盖章证明，三方协议关系到毕业生的干部身份、档案及户籍的挂靠等事项，因此代盖三方协议属于违法行为。