1、缺乏配套细则和操作规范。和有关部门出台了“双随机、一公开”的相关文件，但配套的实施细则仍有待进一步完善，特别是缺乏基层开展双随机抽查的具体操作规程。出台了“双随机一公开”实施方案，虽然明确了监管对象和监管人员之间的双随机，但这些方案基本是原则性的规定，细化的具体操作规范还比较缺乏，现实操作过程还有待解决的很多规范细节问题。2、机构信息归集系统不完善。仅市场监管部门的双随机检查信息较为完善，有相应配套规则，其他部门的双随机检查与双随机监管平台的系统并不完全相适应。