寻常疣的治疗方法多样，包括抗病毒及免疫调节剂。例如，可肌肉注射抗病毒或免疫增强剂，如聚肌胞注射液。局部治疗可使用5%5-氟尿嘧啶软膏、10%水杨酸软膏、复方苯甲酸火棉胶涂剂、斑蝥酊、疱疹净霜等。另外，冷冻、激光、电灼也是常见的治疗方法。同时，服用活血化淤、软坚通络、抗病毒的中药也有一定的效果。由于疣体会在摩擦破损后造成传染，因此，患者应及时寻求治疗，并在治疗过程中做好扁平疣护理工作，避免继发感染。患者应保持良好的个人卫生习惯，避免直接接触他人的疣体，以防感染。治疗期间，应避免摩擦和刮擦疣体，以免造成病毒传播。