上级主管进行问责。擅自减免行政事业性收费属于违法行为，情节严重的，由上级主管部门对单位主要负责人进行问责，根据《中华人民共和国行政收费管理条例》规定，行政机关实施行政事业性收费，应当遵循收费法定、收费公开、分级管理、社会监督的原则。