1、组成不同：操纵元又称操纵子，是指一组关键的核苷酸序列，包括了一个操纵基因、一个普通的启动子，及一个或以上的结构基因被用作生产信使RNA(mRNA)的基元，操纵子至少有一个启动子，在第一个结构基因5侧上游，控制整个结构基因群的转录。2、功能不同：操纵元又称操纵子，是指一组功能相关的结构基因串连在一起，由一个共同的调节基因和一组控制位点构成的一个完整的表达单元，操纵子是原核生物操纵某一特定基因表达的调节单位，包括操纵基因、调节基因和结构基因等部分。