有责任。因为工作中遇自然灾害死亡算工伤。所以是有责任的。经查询律临网得知，根据《工伤保险条例》和《劳动安全生产法》的规定，在工伤事故中，责任人和责任部门都需要承担相应的责任。责任部门包括：企业领导、安全部门、人力资源部门、维修部门等。值班长属于企业领导部门。