一本。根据查询南京航空航天大学官网得知：南航飞行学院是一本院校。南航飞行学院一般是指南京航空航天大学的飞行学院，又名民航学院，属于南航的拳头学院之一。南京航空航天大学是211工程高校，属于国防七子，是工信部下属的七所院校之一。