后备箱导水槽卡扣的防水棉损坏会导致车辆后备箱与车内连接处易受雨水浸泡。后备箱导水槽卡扣的防水棉是为了确保车辆后备箱密封不漏水而设置的，防水棉损坏，就会导致洒落在车顶上的雨水从导水槽卡扣的缝隙渗入车内，给车内物品带来损害。