不可以规定领导干部不打卡。事业单位劳动纪律制度规定领导干部不打卡，是不符合法律法规的，根据《中华人民共和国公务员法》、《事业单位工作人员处分条例》等法律法规规定，公务员和事业单位工作人员应当按照规定的时间和地点参加工作，并进行考勤签到。事业单位的领导干部作为组织管理者和领导者，应当以身作则，遵守法律法规和组织规定，积极履行职责，服务于广大员工和公众。