题主是否想询问“酶切位点的保护碱基是指什么”？指在设计PCR引物时添加的额外序列。在分子生物学实验中，酶切位点的保护碱基是指在设计PCR引物时，人为地在酶切位点序列的端外侧添加额外的碱基序列，用以提高将来酶切时的活性，这种保护碱基的添加是为了防止直接暴露在末端的酶切位点被性核酸内切酶切开。