1、职责不同：助理检察官的主要职责是协助主办检察官对立案案件进行审查、调阅审判卷宗、调查的工作，在规定期限审查终结；检察官助理的主要职责是审查各类案件，对案件进行调查取证。2、性质不同：助理检察官属于检察官；检察官助理属于检察辅助人员。