不合理。克扣工资属于劳动违法行为，在《劳动法》中也有明确规定，用人单位应当每月按时足额将工资发放给劳动者，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，因此，如果美容店扣了学徒2000元工资，是不合理的，可以向劳动监察部门反映或申请劳动仲裁。