1、种属不同：海狸鼠属于海狸鼠科海狸鼠属，而水豚属于豚鼠科水豚属。2、外形不同：海狸鼠的体长为43至63厘米之间，体重为5至10公斤之间，而水豚的体长为106至134厘米之间，体重为35至66公斤之间。