1、性质不同：上饶汽车客运站是指组织公路客、货运输业务的基层单位，而上饶客运中心站是指专门办理客运业务的车站。2、作用不同：上饶汽车客运站是专门办理旅客运输业务的汽车站，而上饶汽车客运站的主要工作分商务和车务两大部分。