不会。录入住建系统并不影响农民工正在领取的失业金。失业金是为了保障失业人员的基本生活而发放的一种社会福利在符合条件的情况下发放给失业人员，在领取失业金期间，失业人员可以享受一定的医疗、生育、取暖等补贴。