1、区别如下：地理位置不同，长兴岛位于辽东半岛中西部，属于辽宁省瓦房店市，崇明岛位于长江三角洲的冲积岛屿，属于上海市。2、面积不同，长兴岛的面积约为1267平方公里，而崇明岛的面积约为10平方公里。3、气候不同，长兴岛属于温带季风气候，崇明岛属于亚热带季风气候。4、地位不同：长兴岛是大连市开放先导区之一。而崇明是岛是中国第三大岛屿。