化肥市场保护的意义在于维护农业生产和国家粮食安全。《关于加强农业投入品管理保障农产品质量安全的干意见》指出：“加强化肥市场监管，完善化肥生产许可和产品质量监管制度，加强对化肥经营企业和经销商的管理和监督，打击非法化肥经营行为，保证化肥质量和使用安全，提高化肥利用率，减少污染，推进农业绿色发展。”化肥市场保护旨在保证化肥产品质量和使用安全，促进农业的健康发展。