违反村民民主程序签订的协议无效后造成的损失村委会承担。由于从合同签订后到经过法定程序认定无效，一般要经过一定时期。承包人可能进行了投入并实施经营活动，合同认定无效后将会出现当事人一方的经济损失，需要进行法律责任的认定。司法实践中，对于合同无效后的法律责任认定方面，由于是否召开村民代表大会的主动权在村委会，村委会在处分集体经济组织财产时也有义务履行民主议定程序，因此村委会对造成该承包合同无效的应承担主要责任。