生物工程学院参加高考和普通高中录取分数线是不一样的。生物工程学院通常会录取更高分数的学生，因为生物工程是一个需要具备较高学术水平和科学素养的专业。此外，生物工程专业还需要学生具备一定的数学、物理和化学基础。因此，生物工程学院的录取分数线通常会高于普通高中的录取分数线。