机械工程专业起源于1986年河海大学机械系的机械制造工艺与设备专业，拥有水利机械二级学科博士点、机械工程一级学科硕士点，为国家一流专业、国家“十二五本科教学质量工程”专业综合改革示范点专业、江苏省品牌专业、江苏省“十二五”重点建设专业类专业，第一批教育部“卓越计划”专业，2019年通过工程教育专业认证。拥有2个国家工科大学生教学实践基地和2个省级示范中心。专业融机械设计、机械制造、机械电子工程于一体，专业涵盖机械设计与智能制造、机器人与机电控制、水利机械及卓越工程师四个专业方向。