医保跨险种特殊门诊指的是在医保范围外的特殊门诊项目，需要通过申请才能享受医保报销。针对您的问题，是否需要更改医保跨险种特殊门诊的申请，需要具体情况具体分析。一般情况下，如果之前已经提交了特殊门诊的申请，且没有发生变化，不需要更改申请。若是有变化，例如治疗项目发生改变或者治疗医院变更，可能需要重新提交申请或者更新申请信息。