海门科技馆和南通科技馆都有不同的特色，海门科技馆是集科技、文化、娱乐为一体的综合性科技馆，展示内容涉及多个领域，并设有互动体验区。南通科技馆以科技展示为主，注重科普教育，展示了多个领域的科技成果和技术应用。如果您对多个领域的科技都有兴趣，并且喜欢互动体验和科普教育，那么海门科技馆更适合您。如果您对某一领域的科技成果和技术应用更感兴趣，那么南通科技馆更适合您。