房租违约金应计入“营业外支出”科目。营业外支出是指企业发生的与其日常活动无直接关系的各项损失，例如非流动资产处置损失、公益性捐赠支出、盘亏损失和罚款支出等等。而房租违约金属于企业支付的违约金类别，与日常活动无直接关系，因此属于营业外支出。需要强调的是，营业外收入和营业外支出应当分别核算，不能混淆，并且营业外支出的余额在期末应该转入本年利润科目，结转后营业外支出科目应无余额。